杨永泰死后，蒋介石让黄绍竑前往担任湖北省政府主席。黄绍竑本想着先去西安跟蒋介石汇报，然后再去湖北赴任。结果恰好听闻杨虎城、张学良在西安发动兵谏，扣押蒋介石。当天何应钦就给黄绍竑发去电报，让他立刻前往南京。 黄绍竑回忆当天开会的时候，虽然存在着和平营救和武力营救两种意见，但参加这次会议的绝大多数人赞成武力讨伐。在这些人看来张、杨行为等同背叛党国，绝无调停可能。如果武力讨伐就可以团结内部，张、杨的部队也可能受此影响发生哗变。如果不下令讨伐，那么可能导致“挟天子而令诸侯”的情况出现，后果不堪设想。 宋子文、孔祥熙等人担心武力讨伐可能会导致蒋介石人身安全受到威胁，但碍于黄埔系军人群情激愤，也不好公开反对。会议当即决定让何应钦为讨逆军总司令进行讨伐。何应钦虽然出身黄埔，但早已经和蒋介石面和心不和，早在1927年宁汉分裂时，何应钦便已经和李宗仁、白崇禧合作。黄绍竑回忆说，蒋介石原本下令让何应钦率第一军向浙江撤退，结果何应钦违背军令带着第一军参加龙潭战役，还和桂系军队联手消灭了孙传芳渡江的北岸军队。何应钦想借着李宗仁、白崇禧的实力来另立一派，与蒋介石分庭抗礼。 对于何应钦来说，无论蒋介石被杀还是被长期扣留，他完全可以争取到黄埔系和其他军阀的支持掌握南京国民政府的军政大权。再说蒋介石一直以来对他颇为忌惮，做起事来束手束脚。再加上何应钦认为如果他一旦得权，凭借他与日本军人的同学关系，也可以和日本人达成协议延缓他们侵华进程。 何应钦被任命为讨逆军总司令后，邀请黄绍竑出任讨伐军总司令部参谋长。何应钦劝黄绍竑先别去湖北赴任，眼下湖北军政大权全在何成浚手中，黄绍竑又没有军队，即使去了湖北当省政府主席肯定也干不好的。 黄绍竑也很坦诚，他在回忆录中提及自己对老蒋玩得就是阳奉阴违那一套，听说西安事变发生后内心也颇为支持。只不过陈诚等人早就怀疑他对蒋介石有异心，为了掩人耳目才赞成讨伐，所以这次何应钦相邀也就顺水推舟答应留在南京。
