清朝是历代王朝经略青藏高原最深入的朝代，百余年间先后十次大规模用兵高原，逐步将西藏、青海、川西纳入中央直接管辖。1717年准噶尔攻占拉萨灭亡和硕特汗国，清军初次入藏征讨惨败；1720年清廷派胤禵统筹大军驱准收复西藏，正式纳入版图，驻军并修建川藏驿道。1723年平定青海罗卜藏丹津叛乱，设立西宁办事大臣，管控青海全境。1728年平定西藏阿尔布巴内乱，正式设立驻藏大臣制度。1747—1749年第一次平定大金川叛乱，稳住川西藏区；1750年平定藏王珠尔墨特叛乱，废除世袭藏王，削弱地方割据权力。1771—1776年彻底平定大小金川，打通川藏战略通道。1788年首次击退尼泊尔廓尔喀入侵西藏；1791—1792年廓尔喀再度大举来犯，福康安率军翻越喜马拉雅攻入尼泊尔腹地，迫其称臣纳贡。战后确立金瓶掣签制度，强化驻藏大臣职权，完善治藏体系。清末英国势力染指西藏，分裂势力作乱。1905至1910年赵尔丰经略川边推行改土归流，川军进驻拉萨震慑分裂势力，清廷筹划设立西康省巩固边疆。最终因辛亥革命爆发，边疆治理进程中断。百余次高原用兵，奠定了近代中国青藏高原疆域的历史根基。